Covid-19 : L’OMS demande à tous les pays de rester vigilants !

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Le Groupe consultatif technique sur l’évolution du virus SARS-CoV-2 (TAG-VE) a tenu une réunion le 3  janvier 2023 pour discuter de la situation concernant la Covid-19 en Chine continentale.

Au cours de la réunion, des scientifiques des CDC de Chine ont présenté des données génomiques provenant de ce qu’ils ont présenté comme des cas importés et contractés localement d’infection par le SARS-CoV-2. Pour les infections contractées localement, les données présentées se fondaient sur plus de 2000 génomes collectés et séquencés à partir du 1er décembre 2022. L’analyse des CDC de Chine a montré une prédominance des lignées d’Omicron BA.5.2 et BF.7 parmi les infections acquises localement.

Les lignées BA.5.2 et BF.7 représentaient ensemble 97,5 % de l’ensemble des infections locales d’après le séquençage génomique. Quelques autres sous-lignées connues d’Omicron ont également été détectées, bien qu’en faibles pourcentages. Ces variants sont connus et ont circulé dans d’autres pays ; à l’heure actuelle, aucun nouveau variant n’a été signalé par les CDC de Chine.

Au 3 janvier, 773 séquences provenant de Chine continentale ont été soumises à la base de données EpiCoV de l’Initiative GISAID ; la majorité d’entre elles (564 séquences) ont été collectées après le 1er décembre 2022. Parmi celles-ci, seules 95 sont classées comme des cas contractés localement ; 187 sont classées comme des cas importés et 261 n’ont pas été affectées à ces catégories.

Parmi les cas contractés localement, 95 % appartiennent aux lignées BA.5.2 ou BF.7. Cela correspond à des génomes de voyageurs en provenance de Chine que d’autres pays ont soumis à la base de données EpiCoV de l’Initiative GISAID. Aucun nouveau variant ni aucune nouvelle mutation significatifs n’ont été relevés dans les données en accès public sur les séquences.

Tout en prenant acte des informations communiquées jusqu’à aujourd’hui, le Groupe consultatif technique rappelle combien il est nécessaire et important de mener des analyses supplémentaires et de mettre en commun les données sur les séquences de façon à comprendre l’évolution du SARS-CoV-2 et l’apparition de mutations ou de variants préoccupants. Cela devrait être fait indépendamment du fait qu’une séquence soit assignée ou non à une lignée PANGO.

Le meilleur moyen d’y parvenir est de déposer rapidement et régulièrement des données dans des bases en accès public. Le maintien de niveaux élevés de surveillance génomique représentative en Chine et dans le monde, l’annotation des séquences génomiques avec des métadonnées cliniques et épidémiologiques pertinentes et la mise en commun rapide de ces données sont indispensables pour une évaluation rapide des risques mondiaux.

L’OMS continuera de surveiller de près la situation en République populaire de Chine et dans le monde et demande à tous les pays de rester vigilants, de surveiller et de signaler les séquences, et de réaliser des analyses indépendantes et comparatives des différentes sous-lignées d’Omicron, y compris sur la gravité de la maladie qu’elles causent.

Actuellement, le Groupe consultatif technique évalue également la proportion en augmentation rapide du recombinant XBB.1.5 aux États-Unis et dans d’autres pays. Une évaluation actualisée des risques associés au recombinant XBB.1.5 est en train d’être établie et mettra à jour la précédente déclaration.

Le Groupe consultatif technique se réunit régulièrement et continue d’évaluer les données disponibles sur la transmissibilité, la gravité clinique et le potentiel d’échappement immunitaire des variants, y compris l’impact potentiel sur les dispositifs de diagnostic, les traitements et l’efficacité des vaccins dans la prévention des infections et/ou des formes graves.

Le Papyrus

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